|
Post by account_disabled on Jan 28, 2024 5:51:12 GMT -5
обеспечивающий быстрое секвенирование даже в сложных условиях. На рынок выходит MinION, недорогой около 1000 долларов США портативный секвенатор с питанием от USB, который обеспечивает быстрое секвенирование даже в сложных условиях например, мышиные лемуры в заповеднике на Мадагаскаре , рептилии в тропических лесах Эквадора , мошкихирономиды и муравьи из Сингапура. Здесь мы применяем секвенирование MinION для получения ампликонов штрихкода ДНК тысяч образцов насекомых с минимальными затратами , используя только самое простое лабораторное оборудование. Чтобы продемонстрировать Список электронной почты отрасли наш рабочий процесс, мы секвенировали штрихкоды ДНК более чем 7000 экземпляров Phoridae мушек, чрезвычайно разнообразного семейства двукрылых, которые были собраны в течение 8 недель с помощью одной ловушки Малеза в национальном парке Кибале Уганда. Мы обнаружили >650 видов. Это превышает число видов мушек, описанных в настоящее время для всего афротропического региона. Эти результаты заставляют нас предположить, что Африка может быть домом для более чем 100 000 видов только Phoridae. Более 90, вероятно, будут принадлежать к одному роду, Megaselia . Рабочий процесс исследования для открытия видов Экономически эффективное обнаружение видов с помощью MinION в таком масштабе становится возможным за счет увеличения емкости штрихкодирования одной проточной ячейки с 500 до 3500 образцов. Это потребовало трех изменений в ранее предложенном нами протоколе .
|
|